Ci sono alcuni misteri che neanche la NASA è in grado di risolvere… "NASA X-Files" si rituffa negli archivi della più grande agenzia spaziale del mondo per rivelarci gli straordinari misteri dell'universo. Ogni episodio considera le prove ed espolara possibili spiegazioni, consultandosi con vari insder, scienziati, astronauti della NASA e altri testimoni di questi strani fenomeni. Come mai le foto fatte dal telescopio Hubble alla cometa del secolo l'hanno fatta apparire come una nave spaziale aliena? La terra è stata già invasa da organismi alieni= Quale forza misteriosa sta frantumando un asteroide nera-Earth? "NASA X-Files" esamina il lato oscuro dell'esplorazione spaziale, mentre astronauti e scienziati svelano misteri apparentemente strappati dalle pagine della fantascienza. È possibile che la NASA sia responsabile di un'esplosione nucleare su Giove? Potrebbero nuove prove finalmente rivelarci cosa si nasconde dietro al mistero dell'iconica faccia su Marte? Quale forza sconosciuta ha fatto schiantare una navicella del programma Apollo sulla superficie della Luna?