Un rinnegato vulcaniano con uno sconcertante segreto dirotta l'U.S.S. Enterprise per andare alla ricerca di un mitico pianeta. Kirk e il suo equipaggio cercano di fermare il folle imbarcandosi in un'avventura che li porterà al centro dell'universo e, forse, di fronte a Dio. Con l'equipaggio sotto controllo del vulcaniano, il capitano deve affidarsi a un'improbabile alleanza per salvare la galassia.