La guerra tra gli Autobot ed i Decepticons imperversa ormai da venti lunghi anni. I Decepticons guidati dal loro leader Megatron hanno riconquistato Cybetron, pianeta degli Autobot, mentre gli Autobot, guidati da Optimus Prime, preparano l'invasione di Cybetron. Ma le scorte non sono sufficienti quindi gli Autobot decidono di andare sulla terra dove vengono attaccati dai Decepticons. Nel frattempo, all'insaputa di tutti, una nuova forza Unicorn, il divoratore di mondi, fa il suo ingresso nell'universo. L'unica speranza di fermarlo è quella di entrare nella Matrice del comando e gli Autobot devono trovare un prescelto che sappia usare il potere della Matrice.